Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4FO95754 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms