Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms