Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC3O15438 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC3O15438 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms