Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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