Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QRK9 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QRK9 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3QRK9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3QRK9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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