Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms