Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms