Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms