Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC6Q9Y210 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms