Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5BQ9UGL1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms