Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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