Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms