Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms