Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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