Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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