Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COMMD5Q9GZQ3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.1 ms