Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5DQ9BY66 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5DQ9BY66 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms