Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms