Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C19orf43Q9BQ61 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms