Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SENP8Q96LD8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms