Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
L3HYPDHQ96EM0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms