Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC58Q96CX6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms