Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms