Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms