Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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