Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLIS1Q8NBF1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms