Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms