Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RNF148Q8N7C7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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