Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF554Q86TJ5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms