Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms