Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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