Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms