Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ZNF549Q6P9A3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF549Q6P9A3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ZNF549Q6P9A3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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