Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB3L3Q68CJ9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms