Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms