Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms