Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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