Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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