Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
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