Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCBQ16585 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCBQ16585 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCBQ16585 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SGCBQ16585 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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