Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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