Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK5Q16478 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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