Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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