Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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