Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms