Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB39AQ14964 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB39AQ14964 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB39AQ14964 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RAB39AQ14964 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB39AQ14964 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB39AQ14964 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms