Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.2 ms