Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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