Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCOA4Q13772 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms