Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTCH1Q13635 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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